В мае 1965 года поступил в число братии Свято-Троицкой Сергиевой лавры, там же был пострижен в монашество с именем Владимир. В 1966 году рукоположен в сан иеромонаха. В 1967 году получает степень кандидата богословия, защитив кандидатское сочинение на тему «Исихастские споры в XIV веке в Византии». В 1971 году возведен в сан игумена.
В 1978 году направлен в ведение Предстоятеля Чехословацкой Православной Церкви Митрополита Пражского и назначен настоятелем храма святых первоверховных апостолов Петра и Павла в Карловых Варах.
1 апреля 1979 года возведен в сан архимандрита и назначен настоятелем вновь открытого в Карловых Варах подворья Русской Православной Церкви.
В апреле 1988 года временно отозван в Москву и назначен начальником штаба по празднования 1000-летия Крещения Руси.
19 июля 1988 года определением Священного Синода освобожден от обязанностей настоятеля подворья Русской Церкви в Карловых Варах. 20 июля 1990 года назначен епископом Ташкентским и Среднеазиатским.
Решением Священного Синода от 27 июля 2011 года назначен на Омскую и Тарскую кафедру. Решением Священного Синода от 6 июня 2012 года назначен главой Омской митрополии.
